তিনি তার পিত্তথলি বাদ দিতে অস্বীকার করে, সেই সময় পিত্তথলি বাদ দেয়া বিপজ্জনক ছিল এবং প্রক্রিয়াটি থেকে লোকেরা মারা যেত এবং তাকে কারাবন্দি করা হয়। পরে তাকে এই প্রতিশ্রুতিতে ছেড়ে দেওয়া হয় যে তিনি অন্যের জন্য খাবার রান্না করবেন না বা পরিচালনা করবেন না, মেরি পালিয়ে যান, নাম পরিবর্তন করেন এবং টাইফয়েড জ্বরের মহামারী ছড়িয়ে রেখে রেস্টুরেন্ট এবং সরকারী প্রতিষ্ঠানে রান্না চালিয়ে যান। বেশ কয়েক বছর পরে, তাকে আবার গ্রেপ্তার করা হয়েছিল এবং কারাবন্দী করা হয়েছিল এবং ১৯৩৮ সালে তাঁর মৃত্যুর আগে পর্যন্ত তিনি হেফাজতে রয়েছিলেন। তিনি টাইফয়েড মেরি নামে পরিচিত।মেরি ম্যালন থেকে টাইফয়েডে আক্রান্ত হয়েছিলেন ৫৩ জন মানুষ, যার মধ্যে তিনজন মারা গিয়েছিলেন এবং মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে প্রথম ব্যক্তি চিহ্নিত হয়েছিল রোগের একটি অসম্পূর্ণ বাহক(asymptomatic patient) হিসাবে।
জিজ্ঞাসাবাদ করে জানা গিয়েছিল যে তিনি প্রায় কখনই হাত ধুতেন না। এ সময় এটি অস্বাভাবিক ছিল না কারন germ theory of disease তত্ত্বটি তখনও পুরোপুরি গ্রহণ করা হয়নি।